從上世紀(jì)80年代以來，中國開始了大規(guī)模的生態(tài)建設(shè)工程，包括防護(hù)林體系建設(shè)、水土流失治理、荒漠化防治、退耕還林還草、天然林保護(hù)、退牧還草、“三江源”生態(tài)保護(hù)等一系列生態(tài)工程均具有明顯的生態(tài)補(bǔ)償意義，投入資金有數(shù)千億之多。2000-2003年，中央政府用于西部基本建設(shè)的國債資金達(dá)到2200億元，占同期國債發(fā)行總量的37%；中央財(cái)政轉(zhuǎn)移支付額從2000年的53億元，迅速增加到2003年的170億元，4年達(dá)到450億元。在中央的基本建設(shè)基金中，用于西部的資金從2000年的170億元，增加到2003年的240億元。2000-2003年，中央用于西部扶貧資金是175億元。從區(qū)域補(bǔ)償?shù)慕嵌瓤矗M管這些財(cái)政轉(zhuǎn)移支付和發(fā)展援助政策沒有考慮生態(tài)補(bǔ)償?shù)囊蛩?，也極少用于生態(tài)建設(shè)和保護(hù)方面，但其對西部地區(qū)因保護(hù)生態(tài)環(huán)境而犧牲的發(fā)展機(jī)會成本，或承受歷史遺留的生態(tài)環(huán)境問題的成本變相給予了一定的補(bǔ)償。天然林保護(hù)、退耕還林等六大生態(tài)工程也是對長期破壞造成生態(tài)系統(tǒng)退化的補(bǔ)償。